針對網友6號線與S1號線貫通運營的詢問，南京地鐵指揮部近日回應，目前處于方案研究階段，推薦方案為6號線與機場線(S1)貫通運營方式。這意味著，祿口機場以后或許可以直達棲霞山，貫通線路將成為南京最長地鐵線。

在2012年地鐵指揮部的網絡回應中曾提出過兩種方案：其一是機場線繼續向北延伸至夾崗，在夾崗設終點站并于6號線起點站進行換乘;其二就是寧高二期繼續延伸并與6號線貫通運營。近日回復中答道：“基本就是方案二了。因為寧高二期已經注定獨立運營了，3門車廂無法進4門車廂站臺了。”寧高二期從站臺設置上不具備貫通運營的條件，而寧溧線貫通運營成本較大客流較少，不易實現。相對而言，機場線與6號線貫通則成為更優選項。

對此有網友擔心貫通以后地鐵線路編號成問題，得到回答：“今后若機場線S1與6號線貫通運營，這僅為運營方式上的考慮，機場線的線路編號仍然為S1。”

據了解，兩者貫通運營后里程達到70.6公里，將成為南京最長地鐵線路，遠超目前里程排名第一的寧天城際一期。目前公布方案中，6號線全線將設置18個車站。機場線現為8個站，兩條線在南京南站相連，即貫通線路或將有25個站點。